Sarbecovirus yang tidak diketahui sebelum ini diturunkan pada kelawar di UK

Sarbecovirus yang tidak diketahui sebelum ini diturunkan pada kelawar di UK
Sarbecovirus yang tidak diketahui sebelum ini diturunkan pada kelawar di UK
Anonim

Para saintis telah menemui RhGB01 sarbecovirus baru setelah memeriksa hanya 53 sampel tinja dari kelawar tapal kuda, memperluas rangkaian geografi dan spesies coronavirus seperti SARS-CoV dan SARS-CoV-2. Agaknya, mereka akan dijumpai di seluruh wilayah Rhinolophidae - dari Australia dan Jepun hingga ke Eropah dan Afrika.

Lebih dari setahun kemudian, sumber wabak coronavirus semasa masih belum diketahui, walaupun terdapat ribuan kajian, laporan WHO, penyelidikan dan banyak lagi. Kelawar tapal kuda (Rhinolophus) dianggap sebagai tuan rumah semula jadi untuk kedua-dua SARS-CoV (sindrom pernafasan akut yang teruk yang muncul pada tahun 2002) dan SARS-CoV-2 kami, tetapi tidak ada pembawa perantara yang menyebarkan virus kepada manusia.

Julat kelawar meliputi sebahagian besar Dunia Lama, tetapi sebagian besar sampel sebelumnya diambil di Asia Timur dan Tenggara: terdapat sekitar 50 coronavirus yang berkaitan dengan SARS dijumpai dalam sepuluh spesies kelawar, 48 daripadanya tergolong dalam sembilan kelawar tapal kuda. Analisis filogenetik novel sarbecovirus - iaitu, coronavirus yang berkaitan dengan SARS - berbentuk tapal kuda di China menunjukkan bahawa mereka sangat berkaitan erat dengan SARS-CoV dan SARS-CoV-2.

Para saintis dari University of East Anglia memutuskan untuk menambah data ini. Penulis kajian itu, yang diterbitkan semalam dalam Scientific Reports, mengumpulkan najis dari puluhan haiwan kecil berbentuk tapal kuda di Somerset, Monmouthshire dan Wales pada bulan Ogos dan September 2020. Haiwan-haiwan itu ditangkap menggunakan perangkap atau jaring yang diletakkan berhampiran ayam jantan dan di hutan.

Kotoran diletakkan dalam tabung steril individu yang mengandungi larutan RNAlater untuk penstabilan RNA, disejukkan dan disimpan beku sebelum dianalisis. Para saintis kemudian melakukan penjujukan genom, yang mengenal pasti virus yang sebelumnya tidak diketahui dalam salah satu daripada 53 sampel. Ia diberi nama RhGB01. Virus ini mengandungi 10 gen pengekodan, sementara SARS-CoV dan SARS-CoV-2 - 11 gen pengekodan dengan kemasukan protein ORF8.

Filogenesis protein lonjakan dan urutan nukleotida telah menunjukkan bahawa RhGB01 digabungkan dalam clade monophyletic dengan BM48-31 / BGR / 2008, sarbekovirus kelawar tapal kuda Blasius (Rhinolophus blasii), yang ditemui pada tahun 2008 di Bulgaria. RhGB01 berbeza dengan kelompok yang mengandungi beta-coronavirus manusia patogenik SARS-CoV dan SARS-CoV-2, tetapi lebih dekat dengan koronavirus yang berkaitan dengan sindrom pernafasan akut yang teruk,”tulis para saintis.

Reseptor utama untuk penembusan SARS-CoV dan SARS-CoV-2 ke dalam tubuh tetap menjadi enzim ACE2, peluang ini diberikan kepadanya oleh motif pengikat reseptor (RBM) dalam domain pengikat reseptor (RBD) dari S-protein - ia membentuk sampul virus. RhGB01 baru berkongsi identiti asid amino 68% dan 67% dengan RBD SARS-CoV dan SARS-CoV-2, masing-masing, tetapi hanya 43% dan 48% serupa dengan mereka dalam RBM. Sebagai perbandingan: virus terdekat yang berkaitan dengan SARS-CoV-2, kelawar dan pangolin mempunyai 89% dan 86% kebetulan dengan RBD SARS-CoV-2 dan 75, 77% dengan SARS-CoV. Sebagai tambahan, RhGB01 menunjukkan sedikit persamaan RBM dengan Virus Sindrom Pernafasan Timur Tengah (MERS). Walau bagaimanapun, ia tidak mempunyai tapak pemisahan furin tambahan di persimpangan protein S1 dan S2, yang khusus untuk SARS-CoV-2.

“Tahap kesamaan yang rendah, kekurangan residu kontak dan perbezaan struktur dibandingkan dengan domain pengikat reseptor SARS-CoV dan SARS-CoV-2, kemungkinan besar menunjukkan kurangnya kemampuan untuk mengikat ACE2. Oleh itu, RhGB01 tidak mungkin menjadi zoonosis jika tidak dimutasi. Tetapi ujian in vitro diperlukan untuk mengesahkan eksperimen kekurangan pengikatan dengan ACE2 atau reseptor lain dalam sel manusia dan untuk menentukan kemampuan untuk mengikat dengan reseptor ACE2 mamalia lain,”kata penulis kajian.

Walaupun RhGB01 tampaknya telah ada selama ribuan tahun, para saintis percaya bahawa perlu dilakukan pengawasan untuk koronavirus pada kelawar tapal kuda di seluruh jangkauannya, begitu juga dengan spesies kelawar yang lain. Bagaimanapun, kedua-dua SARS-CoV dan SARS-CoV-2, mungkin, berkembang sebagai akibat mutasi, penggabungan homolog (pertukaran urutan nukleotida antara dua kromosom yang serupa atau serupa) dan "melewati" melalui sekurang-kurangnya satu inang perantaraan.

Maksudnya, pendahulu virus dari inang semula jadi menerima penyesuaian genetik, yang memungkinkan untuk berjaya menjangkiti orang dan menyebarkan antara kita. Dan di mana terdapat kemungkinan penggabungan sarbecovirus homolog melalui koinfeksi, terdapat risiko zoonosis baru.

Mana-mana kelawar yang membawa virus seperti SARS dapat menjadi kuali untuk mutasi. Dan jika kelawar dengan RhGB01 terinfeksi SARS-CoV-2, ada risiko virus ini akan di hibridisasi - dan virus baru akan muncul, yang sudah dapat menjangkiti manusia,”para penyelidik menyimpulkan.

Disyorkan: